Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SFTPCP11686 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms