Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RARAP10276 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RARAP10276 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RARAP10276 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RARAP10276 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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