Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TMIGD3P0DMS9 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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