Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PARP1P09874 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PARP1P09874 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP1P09874 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms