Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms