Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA2O43364 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms