Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN25C9JDP6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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