Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
GGTLC3B5MD39 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
GGTLC3B5MD39 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms