Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGSF9BQ9UPX0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGSF9BQ9UPX0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms