Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGAP1Q9UPQ3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGAP1Q9UPQ3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms