Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB23Q9ULC3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms