Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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