Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms