Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC180Q9P1Z9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms