Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4Q9P0V3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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