Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CNIH4Q9P003 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CNIH4Q9P003 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms