Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PFDN4Q9NQP4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PFDN4Q9NQP4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PFDN4Q9NQP4 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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