Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SEMA4BQ9NPR2 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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