Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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TMEM27Q9HBJ8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TMEM27Q9HBJ8 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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