Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRRTQ9BXP5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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