Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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C9orf85Q96MD7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
C9orf85Q96MD7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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