Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SAMD8Q96LT4 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms