Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms