Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHMP6Q96FZ7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms