Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PHF3Q92576 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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PHF3Q92576 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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PHF3Q92576 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PHF3Q92576 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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PHF3Q92576 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PHF3Q92576 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHF3Q92576 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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