Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTT0

CLEC4C, C-type lectin domain family 4 member C, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4CQ8WTT0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4CQ8WTT0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms