Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms