Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HERC6Q8IVU3 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms