Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTW8

OTOA, Otoancorin, humanhuman

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOAQ7RTW8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OTOAQ7RTW8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms