Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC149Q6ZUS6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms