Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms