Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PCSK4Q6UW60 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms