Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB6CQ53S08 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB6CQ53S08 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms