Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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AP5B1Q2VPB7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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AP5B1Q2VPB7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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AP5B1Q2VPB7 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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AP5B1Q2VPB7 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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AP5B1Q2VPB7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AP5B1Q2VPB7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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