Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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VAMP3Q15836 ATG10-201ENST00000282185 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PCDHAC1-201ENST00000253807 5299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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VAMP3Q15836 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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VAMP3Q15836 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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VAMP3Q15836 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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VAMP3Q15836 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
VAMP3Q15836 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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