Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TRIP4Q15650 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIP4Q15650 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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