Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TCEA2Q15560 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TCEA2Q15560 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TCEA2Q15560 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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