Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TAF13Q15543 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms