Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CCNIQ14094 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms