Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CUL1Q13616 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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