Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CAMK2DQ13557 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms