Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZBTB20-AS5-203ENST00000628886 819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZRSR1-201ENST00000391338 1673 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PAXIP1-AS2-201ENST00000397551 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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MKRN4PQ13434 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MKRN4PQ13434 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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