Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SRSF5Q13243 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SRSF5Q13243 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms