Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms