Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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SMARCB1Q12824 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMARCB1Q12824 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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