Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 AC091170.1-201ENST00000582983 2190 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
CD164Q04900 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms