Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
E2F1Q01094 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms