Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTBN1Q01082 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms