Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP1Q00587 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms