Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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